La scuola Niekée si fonda su due principali concetti di apprendimento: Niekée VMBO e Agorà.
Niekée VMBO (formazione professionale) prevede fin dal primo giorno di scuola una didattica laboratoriale per gli studenti secondo quattro profili: Produzione, Installazione ed Energia (PIE), Media Design e Tecnologie dell’Informazione e della Comunicazione (MVI), Salute e Benessere (S&W) ed Ospitalità, Ristorazione e Tempo libero (HBR).
Agorà (istruzione secondaria) garantisce invece che lo studente inizi a lavorare sul proprio talento e i propri interessi fin dal primo giorno. Con il supporto di un insegnante/tutor gli studenti mettono in pratica diverse attività che possono rappresentare per loro una sfida importante, prendendo spunto e stimolo da tutto ciò che vale la pena ricercare, sviluppare o fare.